Moodle UM - Plateforme pédagogique de l'Université de Montpellier

This course aims at providing a background in Evolution and Population Genetics. Most of the classes will be based on practical exercises in Population Genetics. Lectures summarizing the theory and explaining how this applies to evolutionary biology will be usually hold after the practical classes to teach you how population genetics can help to answer questions in biology.

Some of the lectures will be provided in a form of streaming videos: you will find the links on this website and be warned through this website when it will be available.

Practical classes will be "normal" sessions, with the professor in the classroom with you. You will be asked to prepare some of the exercises at home before the class. Make sure to do it, this is important if you want to follow the classes and cover all the topics of the course.

Before the first session, you will have to work on a few exercises, just to make sure that you have all basic knowledge in probability calculations. We will provide here a serie of 3 exercices and their corrections, as well as a form summarizing all basic tools in maths and probability that will be needed throughout the course.

Once the theory will be acquired, you will work within small groups of students on a project: you will choose your own question in evolutionary biology and you will build a population genetics model in order to explore your question, tutored by one professor.

Details about the dates and locations of the first classes will be released here very soon.

The goal of this course is to provide participants with the main topics in finance theory the managers should know in their activities. The mathematical sophistication is kept to a minimum. The intuition of results will be preferred to the calculation. The course will cover basic concepts and few advanced ones about portfolio theory, valuation, option and financial structure.

Le cours du mercredi 25 octobre est reporté au lundi 23 octobre à 18h15.

Les examens :

• Contrôle continu 60% de la note finale (2 à 3 tests ou travaux en classe).
  
• Examen final 40% de la note finale. L'examen aura lieu le mardi 19 décembre à 18h00
• Le coefficient du cours est de 2,5 ECTS.

Vous n'avez pas cours le mercredi 1 novembre, ce sont les vacances scolaires et un jour férié.

Programme
Au cours de la journée, des intervenants de l’équipe d’accompagnement à la pédagogie numérique et de l'équipe audiovisuelle vous accompagneront dans la réalisation d’un premier test de podcast.
Après un rapide rappel des éléments apportés par Ariane Dumont dans l’Atelier expert d’octobre 2022 sur le « Podcast en pédagogie », vous aborderez une phase de pratique autour de la production d’un podcast : rédaction d’un script du podcast, découverte de l’équipement, enregistrement et diffusion...

Objectifs
A l’issue de la journée, vous aurez réalisé un premier podcast. La journée vous permettra de :
• revoir les avantages pédagogiques d’un podcast et découvrir différents types de podcasts
• connaître l’équipement des podcast et le manipuler
• enregistrer un premier podcast en test
• savoir diffuser votre podcast sur les outils UM

Prérequis
Avoir visionné le replay de l’ (Ariane Dumont, octobre 2022)

Public : enseignants et IP, chargé de communication des directions et composantes

Ce module de 5 ECTS est destiné aux étudiants de 1ère année du Master Sciences de la Terre, Environnement, Planètes (ex-Master Géosciences - parcours DTRN). Il aborde la Géologie du Quaternaire pour établir un cadre paléoclimatique et géochronologique qui servira à l'analyse géomorphologique. Le but est de fournir des clés de lecture du paysage afin d'identifier et de caractériser les processus de surface responsables des aléas naturels.

In this course, we review many aspects of green finance, climate finance, socially responsible investment. We overview macroeconomic aspects (ecological transition, monetary policy), microeconomic sectors (energy), investment products, risk analysis. We then overview ESG ratings and associated portfolio construction, SRI and climate risks.

The aim of this course is to provide an introduction to long term analysis of economies, specifically questioning the determinants of economic growth. Students are trained to apply methods to study dynamic economic systems. Moreover, the course offers the possibility to understand how economists test the empirical plausibility of their theories, while illustrating the mutual influence between academic thought in economics and the making of economic policy.

Bonjour, voici en pj un guide d'apprentissage pour le travail personnel.

Il s'agit d'une situation clinique d'une personne atteinte de PNEUMOPATHIE.

Vous n'avez pas encore eu le cours, cela vous permet de vous référer à vos expériences et à des recherches personnelles. 

Cela vous aidera lorsque vous aurez le cours en Novembre.

Nous corrigerons ce travail le vendredi 19 septembre matin en groupe.

Cordialement.

DP

1. Linux environnent and command lines
   
2. Basics of bioinformatic/genomics 
   1. Omics basics
   2. Sequencing technologies
      
   3. How genomes are generated
      
   4. Genomic data
3. Databases or where to store genomics data :
   1. Presentation of public databases
   2. How to launch a query to extract genomic data (e.g. NCBI practice)
4. Bioinformatics analysis of genomic data

HA5201P  - Physique avancée pour la réorientation (Mineure Sciences de la PASS)

Etudiants de la PASS de Montpellier et de Nîmes, ce module de 5 ECTS du 2ème semestre de la PASS vous prépare à une éventuelle réorientation dans les filières de Physique, Chimie, Mécanique et Electricité, Energie et Automatisme (EEA) de l'Université de Montpellier. 

Le programme est centré sur la mécanique (mécanique du point, mécanique du solide) et l'électrocinétique.

Il est constitué de 24h d'enseignement (Cours Magistral et TD), et de 9h de travail en autonomie sur la base de fiches de séances, pour un total de 33 h de travail encadré.

Ces séances se déroulent tous les vendredis du 20 janvier au vendredi 7 avril 2023. 

Présentation 

               Dans une première partie, ce module se propose de donner une culture générale autour de l’amélioration des plantes. Une analyse historique de l’amélioration des plantes est réalisée afin d’amorcer une réflexion autour de l’évolution de la vitesse du progrès génétique, des idéotypes et aussi du métier de sélectionneur.

               Dans une seconde partie, les différentes méthodologies pour améliorer les germplasms et pour créer sont décrites. Les schémas utilisés classiquement utilisés en sélection tels que les backcross, les sélections récurrentes, les sélections généalogiques et les tests diallèles sont décrits en détail. Une partie du cours est aussi utilisée pour donner des outils permettant de raisonner / suivre ces schémas de sélection (ex,  calculs d’AGC/ASC, calculs d’héritabilité,  statistiques d’évaluation d’un génotype,…). Ces cours théoriques sont aussi illustrer par des cours réalisés par différents acteurs de l’amélioration des plantes. 

Exemple d’interventions :

·       Guy Clément (retraité CFR/CIRAD) : cours sur la sélection du riz en Camargues

·       Simon Vanderlinden (Rijk Zwaan) : cours sur sélection de la tomate

·       Frederic Bakry (CIRAD) : cours sur la sélection du bananier

·       André Clement-Demange (CIRAD) : cours sur la sélection de l’hévéa

·       Vincent Gensollen (GEVES) : visite du GEVES Montpellier

               L’expérimentation en sélection conservatrice est abordée dans une troisième partie du cours. Les différentes méthodes de production de semences et les différentes manières d’améliorer la production et la qualité des semences sont traitées grâce à l’intervention de professionnels.

Exemples d’interventions :

·       Sophie Colénot (Monsanto) expérience en production de semence

·       Olivier Leblanc ( IRD) différents aspects de l’expérimentation sur les semences

·       David Martinez (Clause Hm) expérimentation en qualité des semenceS

               En plus des cours, les étudiants doivent présenter un exposé dans lequel ils doivent élaborer un programme de sélection sur une espèce cultivée. Pour préparer cette exposé, l’étudiant doit mettre en pratique ce qu’il a vu en cours et aussi avoir des echanges avec des sélectionneurs.

Objectifs

·       Acquérir les bases de génétique et d’amélioration des plantes pour démarrer une activité d’assistant sélectionneur.

·       Acquérir les connaissances pour faire de l’expérimentation en production de semences.

·       Acquérir une culture générale sur l’amélioration des plantes.

·       Savoir analyser un article scientifique.

ECTS : 5

Organisation :

·       CM 30h

·       TD 19,5h

Contrôle de connaissance

·       Oral 30%

·       Ecrit 70%

Mots clé : amélioration des plantes, schémas de sélection, idéotype, production semences

Ce cours (UE) s’intéresse principalement à la variation de caractères sous l’action des forces évolutives que sont la sélection, la dérive  génétique, la mutation et la migration, ainsi que l’influence d’autres paramètres sur l’évolution de ces caractères  (systèmes de reproduction, taille efficace,…). Il est articulé autour de trois axes: (i) la génétique des populations qui s’intéresse à des caractères discrets souvent qualitatifs, (ii) la génétique quantitative qui s’intéresse pour sa part à des caractères dont la distribution est souvent continue. Ces approches permettent de comprendre (iii) l’expression phénotypique et l’évolution des caractères à l’échelle des organismes et des populations et d’appréhender les effets possibles de l’environnement sur ceux-ci. 

Des notions de base sur, par exemple, les stratégies optimales d’allocation de ressources, la théorie des jeux et l’analyse comparative seront données.

Compétences à acquérir :

 -         Acquérir une vue d’ensemble de l’action des mécanismes évolutifs sur l’évolution des caractères et certains traits de vie des organismes ;

-         Acquérir des compétences méthodologiques de résolution de problèmes en biologie évolutive ;

-         Savoir construire un protocole expérimental pour estimer des paramètres d’intérêt ;

-         Savoir interpréter des résultats expérimentaux ;

-         Être capable d’exposer des résultats à l’écrit et à l’oral.

This course is made for biologists, who inevitably need to analyse data collected in natural or experimental populations. The course will provide bases for experimental design, univariate modelling and interpretation of results. Theoretical knowledge behind model building, model writing and model interpretation will be done using (true) examples from ecology and evolution.