M1 S1 : PHYLOGENIE & EVOLUTION (H MBE 111 M)

Resp. Emmanuel Douzery (RDC Bât 22) { emmanuel.douzery@umontpellier.fr }

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L'arbre phylogénétique est un concept central en biologie pour les étudiants des mentions "Biodiversité, Écologie & Évolution" et "Biologie Agrosciences" en général, et des parcours DARWIN-BEE et IMHE en particulier.

En 50h, cette UE se propose d'aborder les thèmes suivants : (o) Historique de la notion d’évolution, (i) Systématique phylogénétique (caractères, code-barres moléculaires, génomique, alignement, homologie), (ii) Représentation phylogénétique (réseaux, arbres, racine, dendrogrammes, topologie, longueurs de branches), (iii) Méthodes d'inférence phylogénétique (distance, cladistique et parcimonie, probabilités et vraisemblance, modèles d'évolution des séquences), (iv) Solidité des phylogénies (bootstrap, comparaison de topologies, corroboration multigénique, arbres de gènes et d'espèces), et (v) Applications et phylogénie de quelques grands groupes (Mammifères, Eucaryotes).