L'objectif de cette UE est de comprendre et d'utiliser des méthodes mathématiques pour reconstruire de manière pratique les relations de parenté de différentes espèces via des principes évolutifs. Plusieurs méthodes sont enseignées (parcimonie/méthodes basées sur les distances/méthodes probabilistes). Les enseignements ont également pour objectif d'enseigner le vocabulaire et les principales notions de systématique évolutive.
Après avoir suivi 3 cours magistraux, les étudiant-e-s se constituent en trinômes et reconstruisent les relations phylogénétiques de 6 espèces actuelles de mammifères, choisies avec leurs enseignants, à l'aide de caractères morpho-anatomiques, comportementaux et moléculaires. Une espèce éteinte est ensuite ajoutée à l'échantillon pour qu'en soit identifiée la position phylogénétique (relation de parenté) parmi les 6 espèces actuelles.