Ce cours à pour objectif de présenter les bases théoriques de écologie des écosystèmes aquatiques et terrestres. Les cours magistraux présentent les concepts et méthodes relatifs aux transfert et flux de matières et d’énergies, à la structure et au fonctionnement des réseaux trophiques, aux rôle des ingénieurs écologiques, et aux impacts des activités humaines (pêche, exploitation forestière, réchauffement climatique, invasions biologiques) sur le fonctionnement des écosystèmes. Une introduction à l’analyse isotopique pour étudier le fonctionnement d’un écosystème est proposé en travaux dirigés.

Quatre sorties terrain seront proposées de façon à présenter de façon synthétique les principaux écosystèmes littoraux et continentaux de la région de Montpellier, ainsi que les principaux dispositifs expérimentaux existant dans la région pour l'étude du fonctionnement des écosystèmes (site expérimental de Puéchabon, Ecotron, etc).